Zbiornik oczyszczający składa się głównie z regulacji obszaru osadzania, obszaru niedoboru tlenu, obszaru aerobenu, obszaru wypuszczania wody, w którym obszary niedoboru tlenu i obszary aerobenu wypełniają wypełniacze, do których przyłączone są mikroorganizmy funkcjonalne.(1) regulacja obszaru osadu może odgrywać rolę regulacyjną wahań ilości wody i usuwać odpady i zawiesiny poprzez przechwytywanie i osadzenie;
(2) obszary niedoboru tlenu mogą usuwać substancje organiczne i odzazotować poprzez denitrofikację;
(3) dalsze usuwanie substancji organicznych w strefie aeroksyjnej, usuwanie azotu amoniakowego przez nitryfikację itp.;
(4) dezynfekcja obszarów wodnych z chlorem.